Benutze Luckis AVS Generator (siehe Eingangspost oder Tutorials Ecke).
Das erspart dir das muxen mit AVIMux (was ja Zeit und Speicherplatz schluckt).
Mit Luckis AVS Generator haste spielend leicht eine AVS Datei mit deinen Frapsvideos beinhaltend, so das du nur noch die AVS Datei mit MeGUI öffnen brauchst.
Container sollte MKV sein, Preset würd ich Slow machen und CRF Faktor würd ich zum Einstieg 21 empfehlen und ggf. dann anpassen.