Also erstmal vielen Dank für die Antworten und Hinweise 
Ich habe den Zero Latency-Haken abgeschaltet. Macht tatäschlich keinen Sinn.
Was den Upload angeht, und wieso ich nicht gleich Lossless hochlade... Ich möchte nicht jeden Monat eine neue Festplatte kaufen um meine Let's Plays aufzubewahren... Was, wenn YouTube mal nicht mehr ist? Dann soll alles futsch sein? Nee, ich bewahre die gerenderten Dateien auf, wie wohl die meisten. Und ja, das mit den 200 MBit ist wahr. Wir haben hier erst kürzlich FTTH bekommen, vorher waren es noch 1Mbit im Upload über DSL. Ich bin so froh, dass das vorbei ist!
Ich weiß ja, dass hier sehr viele den Weg über Avisynth und MeGUI gehen, das will ich auch niemandem ausreden. Aber für mich ist das einfach viel zu umständlich. Die hantiererei mit den ganz Rohdaten, Zwischendaten... etc. Außerdem habe ich beim SSM immer das Problem gehabt, dass ich meine Audiospur vom Mikrofon nicht von Mono auf Stereo hochmischen konnte... Und zwar indem er nur den linken Kanal benutzt, da ansonsten die Lautstärke halbiert ist. An der Stelle habe ich alles wieder runter geschmissen (SSM, MeGUI) und zurück zu Movie Studio gegangen.
Ich ziehe die Datei einfach in die NLE, mach die Cuts (wo nötig), stelle Fade-In und -Out ein. Sage bei der Mikrofon-Spur, dass er nur den Linken Kanal benutzen soll, fertig. Das dauert normalerweise etwa 1 Minute.
Mir geht es in diesem Beitrag auch hauptsächlich um die Renderzeiten... Wenn die aber, wie von euch erwähnt mit ca. "2 x Videodauer" in Ordnung sind, dann muss ich mich damit wohl abfinden.
Was mich aber stutzig gemacht hat, was die Aussage mit den Farbräumen. Wenn ich mit MagicYUV aufnehme und das ganze direkt in YUV420 umrechnen lasse, und dann über x264vfw ebenfalls in YUV420 encodiere, wo werden dann die Farbräume konvertiert? Oder übersehe ich da etwas?