Ok. FFmpeg hat die FPS nicht automatisch erkannt.
Kein Ding. Dann musste das bei FFmpeg beim Ummuxen halt erzwingen.
ffmpeg.exe -r 60/1 "-i "A:\Aufnahme\2017-07-01 21-28-17.mkv" -c:v copy -c:a copy "A:\Aufnahme\2017-07-01 21-28-17.AVI"
Beachte das -r vor der Input Quelle steht und somit das Video erzwingt den Input als 60 FPS Video zu erkennen.
Wenn du das Getan hast und das Video erzeugt hast, überprüfe bitte ob das Video A) 60 FPS hat und B) ob das vom Abspielen her auch OK ist alles.
Die hohe FPS Rate ging aus der MKV hervor. Die MKV arbeitet im Gegensatz zum AVI Container mit Zeitstempel. Sprich der Aufbau ist ein wenig anders. Geht das durcheinander hast du den Salat. 
Das ist z.B. ein Merkmal warum UTVideo nicht in ein MKV Container gehört. Viele Programme kommen damit nicht mehr richtig klar das richtig wieder zu entflechten.
Edit:
Beobachte bitte mal bei FFmpeg selbst, mit welchen Meldungen er die Streams einlesen tut. Steht in einer Zeile alles zusammen mit Auflösung, Farbraum, FPS, usw. Sollte mit 0,0 oder 0,1 gekennzeichnet sein. Audio müsste dann eine Nummer Höher sein mit 0,1 oder 0,2. Da sollte dann was mit PCM drin stehen.
Im Verzwicktesten Fall, wenn das wirklich nicht so will, kannste es noch mal Reencodieren wie folgt:
ffmpeg.exe "-i "A:\Aufnahme\2017-07-01 21-28-17.mkv" -c:v utvideo -c:a pcm_s16le "A:\Aufnahme\2017-07-01 21-28-17.AVI"
Dann reencodiert er dir das noch mal.
